А в 1907 году одним из первых Котомин заканчивает Политехнический и приступает к построй¬ке научно-испытательного судна «Александр Кова¬левский» для биологической станции Мурманского берега. Он не только руководит строительными работами, но и подбирает и обучает команду. Следующие три года карьера складывается просто головокружительно: главный механик Александровского (Пролетарского) завода, заведующий кабельной сетью «Общества электрического освещения 1886 года». Под руководством Котомина реконструируются воздушная и кабельная сети, он проводит опыты по установке на открытом воздухе трансформаторов и аппаратуры и в 1911 году монтирует первую в России открытую подстанцию (для питания Лахты). В 1918 году А. А. Котомин назначается главным инженером Общества электрического освещения, затем главным инженером Объединения государственных электрических станций, техническим директором «Петротока» – «Электротока». Создание и развитие энергетической системы становится главнейшей задачей Котомина на два десятилетия.
До своего ареста Алексей Антонович ещё успеет построить СУГРЭС – Средне-Уральскую электростанцию, и приступить к строительству Камской гидроэлектростанции. Участие в грандиозном проекте по сооружению Дворца Советов в Москве стало его последней работой. После трёх с половиной лет заключения в 1942 году он умирает. Извещение о реабилитации А. А. Котомина получила в 1959 году только его вдова – сын погиб, защищая Ленинград, в первые месяцы войны. И только пять лет спустя Елизавета Эдуардовна Котомина смогла получить пенсию – 42 рубля.
